恒溫恒濕室的整體規劃，因要考慮恒溫、恒濕精度控制指標，同時要考慮潔凈度的要求、無振動干擾、無電磁干擾、適當的照明、安裝成本/工期控制、運轉成本、維護性&彈性等因數，涉及范圍極廣，需建筑、水電、空調、實驗室使用者等各項專業人才共同參與規劃。盡管不少恒溫恒濕室規劃設計，絕大部分需要遷就于既有的建筑物，然而，為避免失誤，設計前應盡可能事先確認下列事項：

1.溫濕度控制范圍

2.溫濕度控制精度

3. 潔凈度要求

4. 照度要求

5. 設備的熱濕量范圍

6. 空調送回風方式

7. 室壓之平衡措施

8. 引入新風之必要性

9. 系統排氣的必要性

10. 保溫隔熱的措施

11. 設施與動力之配置

12. 靜電、振動及噪音

13. 設備空間與空調間

14. 進出通道及更衣緩沖區之安排

15. 足夠維護保養空間

16. 室內凈高與樓板載重

17. 公害、污染與防災

18. 安裝及運轉成本之衡量

19. 美觀性要求

20. 環保要求